Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc50Q810U5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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