Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp8Q80U87 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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