Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms