Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms