Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnf1Q7TSH7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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