Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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