Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mindy1Q76LS9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mindy1Q76LS9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms