Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rph3alQ768S4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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