Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ino80Q6ZPV2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ino80Q6ZPV2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms