Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sbf1Q6ZPE2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sbf1Q6ZPE2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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