Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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