Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms