Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
BC061212Q6P8K3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms