Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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