Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltcQ68FD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms