Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Sdc3Q64519 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc3Q64519 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Sdc3Q64519 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc3Q64519 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Sdc3Q64519 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc3Q64519 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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