Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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