Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc18Q640L5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc18Q640L5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms