Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ss18Q62280 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms