Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Sall3Q62255 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sall3Q62255 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Sall3Q62255 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Sall3Q62255 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sall3Q62255 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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