Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn9aQ62205 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn9aQ62205 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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