Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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