Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cln3Q61124 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln3Q61124 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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