Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JrkQ60976 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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JrkQ60976 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
JrkQ60976 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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