Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stxbp3Q60770 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms