Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf3Q60765 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms