Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a1Q60714 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms