Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms