Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynrgQ5SV85 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms