Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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