Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx25Q3ZT31 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx25Q3ZT31 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx25Q3ZT31 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx25Q3ZT31 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snx25Q3ZT31 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms