Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms