Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNU4

Erich4, Glutamate-rich protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich4Q3UNU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erich4Q3UNU4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erich4Q3UNU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms