Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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