Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp3Q3ULW8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms