Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms