Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Puf60Q3UEB3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Puf60Q3UEB3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms