Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms