Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms