Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LcorlQ3U285 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms