Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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