Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pnpla6Q3TRM4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms