Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f1Q3THK3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2f1Q3THK3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms