Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc69Q3TCJ8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms