Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdgfl1Q2VPR5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms