Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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