Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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