Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisal1Q0VBP7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms