Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spata18Q0P557 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms