Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms